Победитель программы "УМНИК", "УМНИК на СТАРТ", конкурса проектов "Успешный старт" в рамках городской целевой инновацонной программы.
с 2005 года занимается созданием высокоэффективных молекулярно-генетических концепций профилактики, диагностики, лечения хронических воспалительных заболеваний дыхательных путей. Оценивает вклад молекулярно-генетических механизмов в развитие различных паттернов воспаления в дыхательных путях. Выявляет генетические предикторы ремоделирования слизистой оболочки бронхов и их значение в становлении и утяжелении течения хронических обструктивных болезней легких.
За фундаментальные исследования, вносящие большой вклад в развитие науки, разработку и освоение передовой техники, материалов и технологий нового поколения в марте 2011 Константин Рукин удостоен звания Лауреат премии Государственной Думы Томской области
Является победителем инновационного конкурса «Всероссийский конкурс инновационных проектов и идей научной молодежи»2011 года при Президенте РФ (Москва).
В 2011 году за высокие достижения в области инноваций был удостоен звания Лауреат конкурса в сфере образования, науки, здравоохранения и культуры Томской области.
Является автором 17 печатных работ, в том числе полнотекстовых статей и монографии.
